La compréhension approfondie du lymphome non hodgkinien (LNH) est devenue un enjeu majeur, et de nombreuses avancées ont été réalisées depuis l’introduction de la classification de l’OMS en 2001.
Cependant, le risque d’erreurs diagnostiques reste élevé en raison de la grande diversité des lymphomes. On recense en effet plus de 80 sous-types de lymphomes non hodgkiniens, dont certains sont rares et particulièrement complexes à caractériser.
Le test LymphoSign propose une classification fine et précise de ces lymphomes, permettant ainsi une meilleure identification et une prise en charge optimisée des patients.
Ce test est marqué CE-IVD pour une utilisation en diagnostic in vitro, garantissant sa conformité avec les exigences européennes en matière de sécurité et de performance.
Ce test est adapté pour classifier les sous-groupes suivants :
- Lymphome non hodgkinien de haut grade de type B
- DLBCL ABC
- DLBCL GCB
- DLBCL PMBL
- Lymphome non hodgkinien de bas grade de type B
- Lymphome folliculaire (FL)
- Lymphome du manteau (MCL)
- Lymphome de la zone marginale (MZL)
- Lymphome lymphocytique (SLL)
- Lymphomes non hodgkiniens de type T
- Lymphome à cellules T angio-immunoblastique Th(AITL)
- Lymphome anaplasique à grandes cellules ALK positif (ALCL ALK+)
- Lymphome anaplasique à grandes cellules ALK négatif cytotoxique (ALCL ALK- cytotox)
- Lymphome anaplasique à grandes cellules ALK négatif Th2 (ALCL ALK- Th2)
- Leucémie-lymphome T de l’adulte (ATLL)
- Lymphomes à cellules NK/T (NKTCL)
LymphoSign est un test innovant, précis et fiable pour les anatomopathologistes et les biologistes moléculaires. Ce test permet de caractériser les lymphomes non hodgkiniens (LNH).
Il évalue le degré de différenciation des cellules tumorales en analysant le niveau d’expression de plus de 130 marqueurs génétiques pertinents, basé sur une technologie de PCR dépendante de ligation (RT-MLPSeq).
La simplicité du test permet d’obtenir en 24h les résultats de l’analyse à partir de l’ARN tumoral. De plus, le protocole est optimisé pour des échantillons de faible qualité comme les échantillons FFPE.
Grâce à une intelligence artificielle entrainée sur une base de plus de 3000 cas, la plateforme RT-MIS établit la classification la plus probable entre 13 sous-types de LNH B et T.
Liste des marqueurs de LymphoSign
Tous les 137 marqueurs inclus dans le test sont listés et rangés par groupes. Le panel comprend les gènes des cellules B, les gènes des immunoglobulines, les gènes des cellules T, la détection de mutations somatiques récurrentes, les gènes dits « double expressors », les gènes discriminants ABC sont étiquetés en bleu, les gènes GCB en orange, les gènes PMBL en rouge.
Les points clés du protocole
Test In Vitro
- 4 grandes étapes
- 1/2 journée dont 1h à 1h30 de manipulation réelle
- Sensible grâce aux sondes courtes
- Optimisé pour les échantillons FFPE
Séquençage
- Adapté à la technologie Illumina
- Séquençage avec d’autres librairies possibles
- 100 000 reads suffisent par échantillon
Analyses
- Spécificité accrue grâce aux UMI
- Analyse Bioinformatique incluse
- Accès à l’ensemble des données brutes
| Type de cancer | Lymphomes non hodgkiniens B ou T |
| Domaine d’application | Expression génique |
| Durée de la manipulation | ≃4h (sans le séquençage) |
| Temps de travail effectif | ≃1h-1h30 (sans le séquençage) |
| Type d’échantillons | Biopsies tissulaires fraiches, congelées ou fixées et incluses en paraffine |
| Quantité initiale | Entre 50 et 500ng d’ARN dans un volume de 2μL |
| Contenu en réactifs | Sondes ciblant 137 marqueurs d’intérêt, barcodes, primer de séquence |
| Compatibilité matériel | Séquenceurs Illumina® |
| Analyse bio-informatique | Accès à la plateforme d’analyses RT-MIS inclus |
| Données accessibles | Rapport de classification, graphiques d’analyse et données brutes complètes (csv) |
Composition du kit
Ce que contient le kit :
- Mix de sondes de RT-MLPA
- Barcodes Genexpath
- Les amorces de séquençage
Disponible en 8, 16, 24 ou 48 analyses
Résultats obtenus
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Publications liées au test LymphoSign
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Camus et al., Blood Adv 2023
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Defining signatures of peripheral T-cell lymphoma with a targeted 20-marker gene expression profiling assay
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Combining gene expression profiling and machine learning
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Vidéos de formation
Mise en oeuvre du test in vitro RT-MLPSeq pour l’expression relative
Préparation des librairies pour les tests LymphoSign et SarcomaFusion
Lancement du séquençage