Qu’est-ce que la RT-MLPSeq ?
La RT-MLPSeq (reverse transcriptase multiplex ligation-dependant probe amplification associée au séquençage à haut débit) est une technologie innovante qui permet d’analyser avec une grande précision les marqueurs d’intérêt. Grâce à cette méthode semi-quantitative, il est possible d’évaluer simultanément plusieurs marqueurs génétiques, tels que des gènes, des mutations et des translocations chromosomiques, en utilisant des couples de sondes oligo-nucléotidiques spécifiques pour chacun d’entre eux. Cette approche garantit une détection fiable, essentielle à la recherche et au diagnostic de maladies complexes.
Une technologie de pointe pour une analyse fiable et rapide en plusieurs étapes
- Extraction de l’ARN : Selon les modalités habituelles de l’utilisateur. Les échantillons peuvent être à partir de tissus frais, congelés ou fixés et inclus en paraffine (FFPE).
- Rétrotranscription en ADNc : L’ARNm est converti en ADN complémentaire (ADNc) pour garantir une analyse ciblée.
- Hybridation des sondes spécifiques : Contrairement à une RT-PCR classique, des sondes oligonucléotidiques s’hybrident aux jonctions exons-exons de l’ADNc, assurant une analyse spécifique sans interférence avec l’ADN génomique. L’intégration d’unique molecular identifiers (UMI) permet de quantifier le nombre de molécules uniques initiales.
- Ligation et amplification : Les sondes proches sont liées grâce à une ligase, puis amplifiées par PCR tout en intégrant des barcodes (BC) pour une identification précise des échantillons et les séquences adaptatrices aux séquenceurs.
- Séquençage nouvelle génération (NGS) : Le séquençage haut-débit permet de tester plusieurs échantillons et des dizaines de gènes en même temps. Seuls 100 000 reads sont nécessaires pour des résultats robustes. Les données sont analysées via la plateforme bio-informatique RT-MIS, qui permet une interprétation rapide et fiable des résultats.
Pourquoi choisir RT-MLPSeq ?
- Méthode semi-quantitative : Permet une évaluation précise des niveaux d’expression des biomarqueurs.
- Analyse simultanée de plusieurs marqueurs : Détection efficace des gènes, mutations et translocations chromosomiques.
- Spécificité accrue : Détection précise des jonctions exons-exons
- Compatible avec divers types d’échantillons : Adaptée aux tissus frais, congelés ou en paraffine et ne nécessite qu’une faible quantité d’ARN.
Grâce à la RT-MLPSeq, accédez à une analyse de pointe pour une meilleure compréhension des profils génétiques.