Test LymphoTranscript – RUO
LymphoTranscript: détecter plus de 50 transcrits de fusion identifiés dans les PTCL en un seul test
La génétique du lymphome périphérique à cellules T (PTCL) est complexe et englobe plusieurs transcrits de fusion récurrents découverts au cours des dernières années grâce au séquençage à haut débit. Cependant, il n’existe actuellement aucune technologie abordable et rapide pour leur détection simultanée dans des échantillons cliniques.
Le test LymphoTranscript de Genexpath permet de mettre en évidence les transcrits de fusion associés aux Lymphomes T périphériques en un seul test. C’est un test économique.
Il repose sur une méthode de RT-PCR dépendante de ligation (LD-RT-PCR). Cette technique semi-quantitative permet d’évaluer simultanément des translocations chromosomiques ainsi que des mutations somatiques à l’aide de couples de sondes oligo-nucléotidiques spécifiques de chacun de ces marqueurs.
Un protocole simple et rapide
Le test In Vitro se compose de 4 étapes d’une durée totale d’ 1/2 journée environ dont 1h à 1h30 de manipulation réelle.
Le séquençage NGS du test ne nécessite que 100 000 reads par échantillon.
De plus, le test LymphoTranscript peut être séquencé avec d’autres librairies. Les barcodes sont fournis avec le kit.
Une analyse informatique robuste et efficace
A l’issue du séquençage, la plateforme d’analyse en ligne RT-MIS permet l’analyse automatisée des fichiers FASTQ.
Elle fournit alors à l’utilisateur la liste des fusions éventuellement détectées dans l’échantillon biologique ainsi que les informations quantitatives associées.
RT-MIS fournit également la bibliographie relative à ces fusions.
L’utilisation de RT-MIS est donc simple, rapide et sécurisée pour l’utilisateur.
Pour de la recherche uniquement
